مركز الملك عبد الله العالمي للأبحاث الطبية (كيمارك) ينشر سحابة Oracle لإجراء الأبحاث الحيوية حول "كوفيد-19"

اختار مركز الملك عبد الله العالمي للأبحاث الطبية (كيمارك) في المملكة العربية السعودية، أحد المؤسسات البحثية الطبية الحيوية والسريرية الرائدة، سحابة Oracle لتوفير حوسبة عالية الأداء من أجل دعم أبحاثه المعقدة في علاج محتمل لــ"كوفيد-19"، وغيره من الأمراض المعدية.

وفي هذا الصدد، قال الأستاذ الدكتور أحمد العسكر، المدير التنفيذي لمركز كيمارك: "يتمثل أحد أهدافنا الاستراتيجية في إجراء الأبحاث الطبية المتقدّمة حول المشكلات الصحية المعقدة. وعليه، بدأنا في مارس 2020 بتحليل بنية بروتين "كوفيد-19". ويتطلّب فهم جينوم فيروس "كوفيد-19" تحليل البروتين، حيث يأمل الباحثون على مستوى العالم في تحديد المركّبات الدوائية التي يمكن استخدامها لمكافحة الفيروس عبر تحليل البروتينات الهيكلية وغير البنيوية لإعادة إنشاء خيوط البروتين في الفيروس". 

وأضاف أ.د. العسكر: "يتطلّب إجراء مثل هذا البحث أدوات تحليل ومحاكاة متقدمة للحمض النووي، وموارد حوسبة قوية من الضروري توافرها من أجل تشغيل التطبيقات المتقدمة بسلاسة وكفاءة. ولا بد من الإشارة إلى أن كيمارك مجهّز بشكل جيّد بالمختبرات الطبية المتقدّمة والحلول التي من شأنها إجراء تحليل الحمض النووي المتقدّم وأدوات المحاكاة، إلّا ان الحاجة الملحة للعلاج وأولوية المشروع وحجم بيانات البحث الكبيرة المتعلّقة بـ "كوفيد-19" دفعنا إلى اتخاذ قرار بشأن تأمين المزيد من قوة الحوسبة عالية الأداء مقارنة بتلك الموجودة مسبقا".

بدورها قالت د. لمياء العمير، رئيس وحدة البيانات الحيوية والذكاء الاصطناعي في كيمارك": "تمكّنت Oracle  من تلبية احتياجاتنا لتوسيع قوتنا الحاسوبية بسرعة كبيرة، بما يتماشى مع المتطلبات العالية لمشاريع "كوفيد-19". كما تمكنّا من تسريع أبحاثنا وإجراء العديد من الدراسات السريرية الأخرى، من أجل تطوير المزيد من الخيارات حول كيفية معالجة "كوفيد-19" وغيره من الأوبئة التي قد تظهر مستقبلاً. ومن موقعنا كمؤسسة حكومية، نحتاج إلى حفظ جميع بياناتنا في المملكة العربية السعودية. ومن هنا برزت الأهمية الكبيرة لقدرتنا على الوصول إلى جميع الموارد التي نحتاجها من منطقة Oracle السحابية في جدة، وكان ذلك من أبرز العوامل لبدء عملنا معOracle على هذا البحث المهم".

عمل كيمارك بشكل وثيق مع Oracle للأبحاث الذي قدم للباحثين والأكاديميين تقنيات سحابة Oracle ، كما مكنهم من الوصول إلى شبكة الدعم الفني والمشاركة في مجتمع مستخدمي أبحاث Oracle ، من أجل تحديد جميع الموارد اللازمة لمشروع البحث المعقّد. صمّم فريق Oracle بيئة الحوسبة لمركز ـكيمارك والتي جمعت بين الحوسبة عالية الأداء والشبكات والتخزين، وتم الحصول عليها جميعها من منطقة السحابة الخاصة بـOracle  في المملكة العربية السعودية.

من جهته، قال فهد الطريف، قائد عمليات Oracle في المملكة العربية السعودية: "نحن فخورون جدًا بقدرتنا على دعم كيمارك في أبحاثه لمواجهة"كوفيد-19". ويظهر هذا المشروع كيف تمكّنت Oracle من خلال العمل عن قرب مع كيمارك من تطوير ونشر بيئة حوسبة متقدّمة للغاية من أجل دعم الاحتياجات المعقدة للبحث، وتزويد كيمارك بالأدوات التي يحتاجها علماؤه وباحثوه لمعالجة هذه المشكلة الملحّة من جهة، ودعم أبحاثهم المستقبلية في إيجاد حلول للتقدّم والنهوض بصحة ورفاهية سكان المملكة من جهة أخرى".

يضع العملاء اليوم تصوراً جديداً للابتكار وتطوير المنتجات وقياس المخاطر وتقديم التجارب وإحداث تحول نوعي في صناعاتهم باستخدام حلول الحوسبة عالية الأداء HPC من Oracle. وتوفر خدمات الحوسبة عالية الأداء HPC من Oracle Cloud Infrastructure مثيلات حوسبة بسيطة بأسلوب فريد إلى جانب شبكات منخفضة التأخير مع شبكات الوصول المباشر للذاكرة عن بُعد (RDMA) وحلول تخزين موزعة عالية الأداء وقدرات عزل حركة مرور الشبكة لأتمتة المهام والمساعدة في تشغيلها بسلاسة وانسيابية على السحابة. وتدعم سحابة Oracle  مجموعة متكاملة من أعباء العمل في الحوسبة عالية الأداء HPC بما في ذلك CFD والتعطل (crash) والتصميم بمساعدة الكمبيوتر (CAE) وأتمتة التصميم الإلكتروني (EDA) وعرض المؤثرات البصرية VFX ومحاكاة الخزانات والتدريب أو الاستدلال بالذكاء الاصطناعي.